منتجات

رؤى ميكانيكية في عائلة Ca2 + المستقلة من alpha-mannosidases في تعايش الأمعاء البشرية.

تلعب بكتيريا القولون ، المتمثلة في Bacteroides thetaiotaomicron ، دورًا رئيسيًا في الحفاظ على صحة الإنسان من خلال تسخير عائلات كبيرة من هيدرولازات الجليكوزيد (GHs) لاستغلال السكريات الغذائية واستضافة الجليكانات كمغذيات.يتجلى هذا التوسع في عائلة GH في 23 عائلة GH92 glycosidases المشفرة بواسطة جينوم B. thetaiotaomicron.نوضح هنا أن هذه هي alpha-mannosidases التي تعمل عبر آلية إزاحة واحدة للاستفادة من مضيف N-glycans.يحدد الهيكل ثلاثي الأبعاد لاثنين من مانوسيدازات GH92 عائلة من البروتينات ثنائية المجال التي يقع فيها المركز التحفيزي في واجهة المجال ، مما يوفر المساعدة الحمضية (الغلوتامات) والقاعدة (الأسبارتات) للتحلل المائي في الكالسيوم (2 +) - بطريقة تعتمد.توفر الهياكل ثلاثية الأبعاد لـ GH92s المعقدة مع المثبطات نظرة ثاقبة على الخصوصية والآلية والمسار المطابق للحفز.يلعب Ca (2+) دورًا محفزًا رئيسيًا في المساعدة على تشويه mannoside بعيدًا عن تشكّل كرسي الحالة الأرضية (4) C (1) نحو حالة الانتقال.تشيم.بيول.6 ، 125-32 ، (2010）

كروماتوغرافيا التقارب الجبهي للجليكواسباراجين البيضاوي على عمود كونكانافالين A-sepharose.دراسة كمية لخصوصية ربط المحاضرات.

تم فحص تفاعلات كونكانافالين A (ConA) المثبَّت من Sepharose 4B مع 10 glycoasparagines المشتقة من الألبومين البيضاوي كميًا عن طريق كروماتوجرافيا التقارب الأمامي.في هذه الطريقة ، يتم تطبيق محلول كربوهيدرات بشكل مستمر على عمود ConA-Sepharose ويتم قياس تأخر جبهة الشطف كمعامل لقوة التفاعل.يمكن تحديد ثابت التفكك (Kd) لكل سكاريد مع ConA.أظهر تحليل ارتباط p-nitrophenyl-alpha ، D-mannoside أن خصائص الارتباط لـ ConA لا تتغير بشكل أساسي بعد التثبيت في Sepharose 4B.تم تصنيف كل من الجليكوسباراجين البيضاوي مع التريتيوم بواسطة طريقة المثيلة الاختزالية للتحليل.أظهرت مقارنة قيم Kd التي تم الحصول عليها أن ارتباط ConA يختلف اختلافًا كبيرًا مع اختلافات هيكلية طفيفة جدًا في سلسلة الجليكوزيل.تشير النتائج إلى أن ConA يتعرف على بنية سلسلة جليكوزيل محددة ، Man alpha 1-6 (Man alpha 1-3) Man ، حيث يجب أن تكون مجموعة هيدروكسيل واحدة على الأقل في الموضع C-3 من المانوز المرتبط بـ C-6 خالية.